Тихий и незаметный старшеклассник Синдзи Такахаши обладает редкой способностью — он интай, человек, чье присутствие окружающие попросту перестают замечать. Это не магия и не проклятие, а странный психологический феномен: стоит Синдзи замолчать и уйти в себя, как одноклассники перестают его видеть, учителя не вызывают к доске, а в толпе его толкают, не извиняясь. Он привык к одиночеству, проводя дни в пустом классе на крыше или в библиотеке, где никто не мешает. Но однажды его способность выходит из-под контроля: во время драки двух школьных группировок Синдзи случайно делает «невидимым» целый коридор, и в суматохе кто-то похищает из кабинета директора важные документы. Теперь парень оказывается в центре расследования, которое ведет не только школьная администрация, но и загадочная девушка из параллельного класса — Юки, которая, кажется, единственная способна видеть Синдзи даже тогда, когда он пытается исчезнуть. Она не просто замечает его, она утверждает, что тоже интай, но в отличие от него научилась контролировать этот дар. Юки предлагает Синдзи сделку: она поможет ему разобраться с его силой, если он поможет ей найти тех, кто использует интай для преступлений.
Вместе они погружаются в теневой мир, где люди с их способностью работают шпионами, ворами и даже убийцами, стирая себя из реальности по заказу. Синдзи узнает, что его «незаметность» — не случайность, а наследственный дар, который его мать намеренно подавляла в детстве, чтобы уберечь сына от опасного сообщества. Но теперь, когда он раскрыт, за ним начинают охоту и коррумпированные чиновники, и тайная организация, собирающая интаев для своих целей. Синдзи приходится учиться не просто исчезать, но и манипулировать восприятием других, оставляя ложные следы и создавая иллюзии. Параллельно он пытается понять, почему Юки так одержима поиском некоего «Архитектора» — человека, который, по слухам, способен навсегда стереть любого из памяти мира. В процессе расследования Синдзи сталкивается с моральной дилеммой: его сила может сделать его идеальным героем, спасающим людей незаметно, или же превратить в монстра, которого никто не вспомнит. Когда выясняется, что его собственная мать была когда-то правой рукой Архитектора, Синдзи оказывается перед выбором — навсегда исчезнуть, защитив близких, или научиться быть видимым, рискуя всем.