Мир изменился, когда из глубин океана поднялись Левиафаны — гигантские биомеханические существа, чья плоть переплелась с ржавеющими обломками затонувших городов. Они не просто монстры; каждый Левиафан — это ходячий континент, несущий на своей спине остатки человеческой цивилизации. Люди, выжившие после Великого Потопа, теперь ютятся в трущобах, выстроенных прямо на спинах этих чудовищ. Ресурсы на исходе, а единственный способ добыть воду, еду и топливо — отправиться в опасный рейд на соседнего Левиафана. В этом мире, где земля под ногами — живая и дышит, каждый шаг может стать последним. Главный герой, Кай, — молодой ныряльщик, чья работа заключается в том, чтобы проникать вглубь тел Левиафанов и извлекать из их кровеносной системы ценный «амброзий» — вещество, заменяющее человечеству нефть и кислород. Кай — изгой в своем поселении, его презирают за то, что он сын предателя, который якобы продал свой народ Левиафанам. Но когда его родной Левиафан начинает умирать от неизвестной болезни, а соседние стаи готовятся к миграции, именно Кай оказывается единственным, кто способен понять язык этих созданий. Он слышит их мысли, чувствует их боль и страх, и это проклятие становится его единственным оружием.
Пытаясь спасти свой дом, Кай заключает опасный союз с капитаном пиратского корабля-охотника, женщиной по имени Айрис, которая ненавидит Левиафанов всей душой. Ее семья погибла во время первого Исхода, и теперь она зарабатывает на жизнь, убивая детенышей этих гигантов. Вместе они отправляются в путешествие к легендарному «Сердцу Океана» — месту, где, по слухам, спит самый первый Левиафан, прародитель всех остальных. По пути они сталкиваются с сектантами, поклоняющимися Левиафанам как богам, с подводными мутантами, которые когда-то были людьми, и с военными фракциями, мечтающими поработить всех гигантов. Кай узнает страшную правду: Левиафаны — это не случайная мутация, а биологическое оружие, созданное древней цивилизацией для очищения планеты от загрязнения. Люди для них — паразиты, и если не найти способ договориться, Левиафаны сбросят свои «города» в пучину и уйдут навсегда, оставив человечество умирать на пустынных берегах. В финале Каю предстоит сделать выбор: уничтожить Левиафанов, чтобы дать людям шанс начать все с нуля на суше, или пожертвовать собой, став мостом между двумя видами, и навсегда изменить природу человека, превратив его в симбионта, живущего в гармонии с гигантами. Но цена этого союза — потеря всего, что люди считали своей идентичностью.