Второй сезон застает героев спустя три года после событий финала. Казалось бы, угроза временного коллапса устранена, но цена победы оказалась чудовищной. Главный протагонист, пожертвовав собой, чтобы стабилизировать разрыв в хронологической ткани, оказался выброшен в «слепую зону» — эпоху, стертую из памяти вселенной. Его тело стремительно стареет, подчиняясь ускоренному течению времени в этой аномалии, а разум начинает фрагментироваться, смешивая воспоминания из разных эпох. Оставшиеся в живых члены команды, включая девушку, чья любовь стала катализатором его жертвы, отказываются верить в его гибель. Они обнаруживают, что их собственные часы жизни теперь синхронизированы с его состоянием: каждый раз, когда он теряет часть себя в прошлом, у них выпадают целые дни из настоящего. Параллельно в мире начинают происходить «хроно-отражения» — фантомные копии разрушенных цивилизаций, которые накладываются на современные города, вызывая парадоксы, способные уничтожить реальность.
В поисках способа вытащить героя из ловушки, команда вынуждена обратиться к запретному знанию — артефакту, позволяющему путешествовать не в прошлое, а в «потенциальное будущее», которое никогда не наступит. Там они сталкиваются с альтернативными версиями самих себя, которые пошли по другому пути: кто-то стал тираном, использующим время как оружие, кто-то — отшельником, оплакивающим мир, который мог бы быть. Главный антагонист сезона — не внешний враг, а сама концепция «неизбежного распада». Время начинает вести себя как живой организм, атакующий тех, кто пытается его обмануть. Кульминацией становится осознание, что спасти друга можно лишь одним способом — синхронизировать его умирающее тело с «нулевой точкой» начала всей временной линии, что грозит уничтожить саму причину, по которой герои вообще встретились. Финал оставляет зрителя перед мучительным выбором: стереть историю, чтобы сохранить жизнь, или принять потерю, позволив времени течь своим чередом, но навсегда изменив каждого из выживших.