Хару, всё ещё работающая консьержкой на курортном острове Покемонов, постепенно привыкает к ритму жизни, где каждый день приносит нового гостя и новый вызов. Её навыки общения с покемонами отточились, но она всё ещё учится понимать их глубже, особенно когда речь заходит о сложных эмоциях. Всё меняется с прибытием загадочного тренера по имени Рен, который путешествует с необычным и очень тревожным Мью. В отличие от игривых сородичей, этот Мью кажется замкнутым, почти апатичным, и постоянно создаёт вокруг себя тихие, едва заметные искажения реальности — то ли в шутку, то ли в попытке спрятаться. Рен, молодой человек с усталыми глазами, признаётся Хару, что поймал этого Мью в очень странном месте, похожем на разрыв между мирами, и с тех пор покемон не проявляет никаких эмоций, кроме глубокой печали. Хару, чувствуя знакомую боль от непонимания, решает во что бы то ни стало помочь. Она погружается в изучение древних легенд острова, которые гласят, что Мью — хранители воспоминаний, и если покемон потерял свою искру, значит, он потерял часть себя. Вместе с Псидаком, который неожиданно начинает проявлять эмпатию к Мью, и старым мудрым Слоукингом, Хару отправляется в запретную часть острова, где время течёт иначе. Там, среди руин храма, она находит зеркальный бассейн, способный показывать не отражение, а суть души. Глядя в воду, Хару видит не своё лицо, а череду образов: разрушенный город, одинокого ребёнка, плачущего в темноте, и Мью, который пытается его утешить, но сам разбивается на тысячи осколков. Она понимает, что этот Мью — не просто покемон, а эхо трагедии, застрявшее между мирами. Чтобы спасти его, Хару должна не успокоить, а разбудить — заставить его вспомнить, кто он есть на самом деле.
Кульминацией становится ночь, когда остров накрывает редкий метеоритный дождь, который, по поверьям, усиливает связь между измерениями. Мью начинает светиться, и его искажения становятся опасными, угрожая разорвать ткань реальности прямо в лобби отеля. Хару, понимая, что времени нет, решается на отчаянный шаг. Она берёт Псидака, чьи экстрасенсорные способности резонируют с энергией Мью, и входит в одно из искажений. Внутри она оказывается в пустоте, где эхом звучат голоса и воспоминания. Хару кричит Мью, что он не один, что его боль — это не наказание, а мост. Она протягивает руку, и в этот момент Псидак, используя всю свою силу, создаёт мост из чистой радости — он начинает танцевать, глупо и искренне, заставляя Хару смеяться сквозь слёзы. Этот смех, вибрация жизни, пробивает брешь в панцире Мью. Покемон вспоминает: он был не жертвой, а защитником, который пожертвовал собой, чтобы спасти других в том разрушенном мире. Его печаль была не слабостью, а силой, которую он забыл. Мью взрывается светом, и искажения схлопываются, превращаясь в огромный, сияющий цветок, который мягко опускается на пляж. Рен, наблюдающий за этим, наконец-то видит, как его Мью улыбается — впервые за долгое время. Покемон подлетает к Хару и касается её лба, передавая частичку своей силы, позволяя ей навсегда запомнить это чувство единения. Отель возвращается к мирной жизни, но Хару меняется навсегда. Она больше не просто консьержка, решающая бытовые проблемы. Она становится хранительницей душ, понимая, что каждый покемон, даже самый могущественный, ищет того, кто сможет увидеть его настоящего. В финальной сцене Хару сидит на веранде, обнимая Псидака, и смотрит на закат. К ней подходит новый гость — маленькая девочка с застенчивым Иви. Девочка шепчет, что её покемон боится темноты. Хару улыбается, встаёт и говорит: «Не бойся. Здесь каждый найдёт свой свет». Часть вторая заканчивается не точкой, а многоточием, оставляя зрителя с тёплым чувством, что приключения на этом острове только начинаются, и впереди Хару ждёт ещё много тайн, спрятанных в сердцах покемонов.